Enkelte eldre prosjekter i databasen, særlig fra før år 2008, kan fremstå med mangelfull informasjon på grunn av overgang til nytt nettsted. Vi jobber fortløpende med forbedringer, skulle du oppdage feil, ikke nøl med å ta kontakt med prosjektansvarlig hos oss.
Prosjektnummer
Tracing Viral Disease Dissemination in Aquaculture: An Interdiciplinary Approach Between Molecular Virology and Dispersal Modelling
The project has employed an interdisciplinary approach of molecular virology and stochastic disease modelling. During 2007–December 2009 there has been a total of 33 verified outbreaks of ISA in salmon farms in Norway. 17 of these outbreaks form a cluster in a local area in Troms County. The main activity in the project has been sampling fish from these outbreaks and sampling fish from farm locations that were considered to be at risk of ISAV infection due to potential contact with farms with ISA. At-risk-farms were not under suspicion of ISA and were selected due to proximate location to farms with ISA, due to shared ownership with ISA farms or due to sharing smolt suppliers. Furthermore, juvenile fish from smolt producers that delivered fish to farms with ISA outbreaks have been sampled. The most important achievements in the project have been the gathering of convincing evidence for local horizontal transmission of ISAV giving rise to local ISA epidemics. Furthermore, a substantial number of HPR0-subtype ISAV's have been isolated, and low virulence of this subtype has been substantiated. Finally, a stochastic model framework for ISAV transmission between fish farms, accounting for the genetics of the virus, has been developed.
The results from this show a clear effect of genetic distance. The effect of seaway distance on infection intensity, which is a central part in both the previous and the new version of the model, has been estimated with improved precision.
Slektskapsanalysene bygger på virus isolert fra norske bestander av oppdrettslaks innsamlet i perioden januar 2007 til august 2009. I denne perioden ble det stadfestet 30 utbrudd av ILA i Norge, og det ble i tilegg tatt prøver fra nærliggende lokaliteter til lokaliteter med ILA, til sammen 28 risikolokaliteter.
Dette prosjektet har vist at når fisk på en lokalitet får ILA, så øker risikoen for at nærliggende lokaliteter også blir smittet. Det er derfor viktig å opprettholde en bekjempelsesstrategi som tar sikte på å begrense lokal smittespredning.
Statistisk analyse av hvilke faktorer som forklarer nært slektskap mellom ulike ILA-virus viste at kort sjøavstand mellom lokaliteter der virus ble isolert har størst forklaringskraft. Det var for eksempel en høy grad av likhet mellom arvestoffsekvenser fra ILA-virus isolert innen den lokale epidemien i Troms, noe som tyder på at smitten har spredd seg mellom disse lokalitetene. Man fant også at ILA-virus var hyppig forekommende i fisk på risikolokalitetene, hvor en stor andel viste seg å være en variant av viruset som tydeligvis ikke fører til sykdom.
En mulig forklaring på hvordan ILA utbrudd oppstår er at varianter av ILA-viruset som i utgangspunktet ikke er forbundet med sykdom kan endre seg og bli sykdomsfremkallende. Avhengig av beliggenheten til den rammede lokaliteten og oppdrettsaktiviteten i nærområdet, kan en da få et enkeltstående utbrudd, eller en lokal epidemi der smitte sprer seg mellom naboanlegg. En slik dynamikk forklarer godt det utbruddsmønsteret av ILA man har sett i Norge i de senere årene. Prosjektgruppen tror at det relativt lave antallet av ILA-utbrudd som har vært registrert per år siden 1993 skyldes at myndighetene har iverksatt hensiktsmessige tiltak ved sykdomsutbrudd, det vil si tiltak som reduserer risiko for videre smittespredning i nærområdene. Det er imidlertid mange ILA-utbrudd som ikke kan forklares gjennom smitte fra nærområdet, og videre forskningsaktivitet bør se nærmere på varianten av ILA-virus som ikke er sykdomsfremkallende for å få økt kunnskap om hva infeksjon av denne varianten betyr med tanke på risiko for å få utbrudd av ILA.
Formidling
Formidling har utgjort 8 internasjonale foredrag, 2 nasjonale foredrag, 1 populærvitenskapelig artikkel i Norsk Fiskeoppdrett nr 8 (2010) og to vitenskapelige publikasjoner for publisering i internasjonale tidsskrift.
Publikasjoner
• Lyngstad T. M., Hjortaas M. J., Kristoffersen A.B., Markussen T., Karlsen E.T., Jonassen C.M., Jansen P.A. Use of molecular epidemiology to trace transmission pathways for infectious salmon anaemia virus (ISAV) in Norwegian salmon farming. Accepted for publication in Epidemics 11 nov 2010.
• Jansen P. A., Lyngstad T. M., Hjortaas M.J., Kristoffersen A. B., Karlsen E., Johansen E. J.. Bruk av slektskapsanalyser til sporing av spredningsveier for infeksiøs lakseanemi (ILA)virus. Norsk fiskeoppdrett 8 (2009).
-
Presentasjon: Modell for slektskapsanalyse for Infektiøs lakseanemi (ILA) virus
Veterinærinstituttet. Havbruk 2010, Trondheim 19. - 21. april 2010. Foredrag av T. M. Lyngstad, M. J. Hjortaas, A. B. Kristoffersen, E. Karlsen, E. J. Johansen, C. M. Johansen og P. A. Jansen.
-
Rapport: Tracing viral disease dissemination in aquaculture: An interdiciplinary approach between molecular virology and dispersal modelling
Veterinærinstituttet.
-
Sluttrapport: Tracing viral disease dissemination in aquaculture: An interdiciplinary approach between molecular virology and dispersal modelling
Veterinærinstituttet. 15.02.2010.
Background
Viral diseases are a large problem in Norwegian salmon farming imposing economic as well as welfare-related challenges to the industry. In order to control viral disease dispersal, knowledge on the dispersal pathways of the disease agents and key factors affecting the interaction between the disease agent and the host, are vital.
Molecular virological methods have proven useful for sensitive detection as well as genomic characterisation in studies on molecular epidemiology of important viral diseases, making use of phylogenitical analyses and identification of mutations important for virulence. Concomitantly, stochastic modelling of infectious diseases, and the spread of disease in aquaculture systems, is a developing field. The contribution from such models is that they may predict the space-time dynamics of disease dispersal.
When disease dispersal is reasonably predicted, models can also be valuable as tools to simulate scenarios of importance to disease control or disease surveillance. However, model precision is critically dependent on knowledge of the biological and environmental factors that govern the development of host-pathogen interactions, and thus disease development.
ILA er en smittsom og alvorlig sykdom for oppdrettslaks som forårsakes av ILA-virus. Praktisk talt alle lakseproduserende land har erfart større epidemier med ILA, med betydelige tap og reduksjon i produksjon som følge.
I Norge bekjempes ILA etter et relativt strengt regelverk som tar sikte på å fjerne smittekilder ved å fjerne ILA syk fisk og båndlegge smittede lokaliteter. Dette er fundert på tidligere erfaring for at lokaliteter som ligger nært til lokaliteter med ILA syk fisk, eller nært til slakterier, hadde større risiko for å bli smittet. Med andre ord, at ILA-virus smitter fra smittekilder med syk fisk eller annet kontaminert materiale til mottakelig fisk i nærområdene. De viktigste smitteveiene til ILA-virus blir imidlertid diskutert. Det har vært hevdet at ILA-viruset hovedsakelig smitter vertikalt fra foreldrefisk til avkom. Dersom dette er dominerende smittevei må ILA smitte først og fremst bekjempes i stamfiskpopulasjonene, mens eksisterende regelverk er lite hensiktsmessig.
To disentangle major transmission pathways for infectious salmon anaemia virus (ISAV) in salmon farming, and ultimately develop more precise models for viral disease dispersal in salmon farming.
Sub-goals
1. To base the studies on phylogeny and virulence of different strains of ISAV.
2. To initiate studies on the prevalence of non-virulent ISAV isolates circulating within farmed salmon populations, and the possible role of these in disease dissemination.
3. To utilise the phylogenetic relationships between virus isolates to assess model predictions regarding transmission pathways for ISAV.
4. To initiate the incorporation of molecular characteristics of virus isolates, eg. phylogeny, into disease dispersal models to ultimately increase model precision.
Målet med prosjektet er å bruke slektskap mellom gensekvenser fra ILA-virus for å sannsynliggjøre ulike smitteveier for ILA-viruset.
The contribution from developing such models is that they may predict the space-time dynamics of disease dispersal. When disease dispersal is reasonably predicted, models can be valuable as tools to simulate scenarios of importance to disease control or disease surveillance.
Økt kunnskap og forståelse av ILA-virus dynamikk og smitteveier er viktige bidrag for at næring og forvaltning skal kunne iverksette effektive tiltak for å bekjempe spredning av ILA-virus.
This project will use an interdisciplinary approach of molecular virology and stochastic disease modelling to disentangle major transmission pathways of infectious salmon anaemia virus, and molecular characteristics of virus traits that may affect the probability of disease outbreaks.